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流程:qiime2工作流[qiime2workflow_s]

流程包括:PE原始数据生成qza、dada2 (paired)、alpha指数、vsearch分类等
PE原始数据生成qza

使用qiime tools import 命令,将PE原始数据生成qza

alpha指数

使用qiime diversity alpha命令,计算多样性alpha指数:shannon,chao1,ace,simpson等

vsearch分类

使用qiime feature-classifier classify-consensus-vsearch命令,对物种序列分类

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