1. PE原始数据生成qza
介绍
使用qiime tools import 命令，将PE原始数据生成qza
输入
fastq文件夹
结果
demux-paired-end.qza
2. dada2 (paired)
介绍
会用命令qiime dada2 denoise-paired
输入
reads序列的qza
结果
feature-table.csv
repset-seqs.qza
3. alpha指数
介绍
使用qiime diversity alpha命令，计算多样性alpha指数：shannon,chao1,ace,simpson等
输入
table_qza
结果
表格文件
4. vsearch分类
介绍
使用qiime feature-classifier classify-consensus-vsearch命令，对物种序列分类
输入
qza格式文件
结果
分类表的qza格式文件
