生物信息学

1 生物信息学基础 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学在生物学、医学及生物技术中的应用 1.3 生物数据类型与来源 1.4 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学等基础知识 2 计算机科学基础 2.1 数据结构和算法 2.2 编程语言（Python，Perl，Java等） 2.3 Linux操作系统使用 2.4 数据库原理与应用 3 生物统计学基础 3.1 描述性统计分析 3.2 假设检验 3.3 回归分析 3.4 多元统计分析 4 分子生物学基础 4.1 DNA复制与修复 4.2 RNA转录与翻译 4.3 蛋白质折叠与功能 4.4 基因表达调控 5 生物序列分析 5.1 序列比对方法 5.2 核酸序列同源性搜索工具（如BLAST） 5.3 蛋白质序列同源性搜索工具（如PSI-BLAST） 5.4 多序列比对软件（如ClustalW） 6 生物数据库查询与管理 6.1 常用生物数据库介绍（如NCBI，Ensembl，UniProt等） 6.2 生物数据库查询技巧 6.3 生物数据库数据下载与格式转换 6.4 生物数据管理系统 7 基因组注释与功能预测 7.1 基因结构预测 7.2 基因功能注释 7.3 非编码RNA的识别与功能预测 7.4 系统发育树构建与分析 8 转录组测序数据分析 8.1 RNA-seq实验设计 8.2 测序数据质量控制 8.3 转录本组装与表达量计算 8.4 差异基因表达分析 9 蛋白质组学数据分析 9.1 蛋白质鉴定与定量 9.2 蛋白质相互作用网络构建 9.3 蛋白质结构预测与功能分析 10 单细胞测序数据分析 10.1 单细胞测序技术概述 10.2 单细胞测序数据预处理 10.3 单细胞聚类与轨迹推断 10.4 单细胞差异表达分析 11 生物信息学软件与工具 11.1 生物信息学常用软件简介 11.2 R/Bioconductor包的应用 11.3 Python生物信息学库的使用 11.4 生物信息学工作流与自动化工具 12 生物信息学项目设计与实施 12.1 生物信息学实验设计与数据采集 12.2 生物信息学数据清洗与预处理 12.3 生物信息学数据分析与结果解读 12.4 生物信息学结果可视化与报告撰写