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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
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STRING是计算机科学中的一种数据类型,它用于存储文本信息。在大多数编程语言中,字符串是一组字符序列,可以包括字母、数字、标点符号和其他特殊字符。 字符串通常被引号包围,以表示它们是一个整体。例如,在Python中,我们可以这样创建一个字符串: ```python my_string = "Hello, World!" ``` 在这个例子中,"Hello, World!"就是一个字符串。 字符串的一个重要特性是它们是不可变的,这意味着一旦创建了一个字符串,就不能改变它的内容。如果你试图改变一个字符串的内容,实际上会创建一个新的字符串。 字符串有许多内置的操作和方法,包括连接(concatenation)、分割(splitting)、搜索(searching)和替换(replacing)。这些操作使得处理文本数据变得容易。 例如,你可以使用加号(+)来连接两个字符串: ```python first_name = "John" last_name = "Doe" full_name = first_name + " " + last_name print(full_name) # 输出:John Doe ``` 你也可以使用索引来访问字符串中的单个字符: ```python name = "Alice" print(name[0]) # 输出:A ``` 总的来说,字符串是编程中一种非常基本和重要的数据类型,几乎所有的编程任务都会涉及到字符串的处理。

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