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介绍

megagene基因预测软件生成的的结果是表格形式,包含基因在长序列中的位置信息, 根据该表和预测用的长序列,提取基因的核酸序列

输入

metagene的预测结果表: 例如 # scaffold4 61.7 # gc = 0.698128 # bacteria 1 4513 - 0 539.403 partial (lack 3'-end) 4450 5127 - 0 37.5313 complete # scaffold3 61.3 # gc = 0.738649 # bacteria 1 85 - 0 10.6447 partial (lack 3'-end) 30 2327 + 0 433.438 complete 2354 9268 + 0 1287.43 complete 9184 9295 + 0 20.3604 partial (lack 3'-end) 预测用的长序列文件(fasta格式) 例如 >scaffold4 AAAAAAAAGCTACTTGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCAGGAGGTCGGGAAA..... >scaffold3 TGGAGTACCAATAATAAAGTGAGCCCACCTTCCTGGTACCCAGACATTTCGAGTACCAATAATAAAGTGA......

结果

基因的核酸序列文件(fasta格式)
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