宏基因组关联研究（Metagenome-Wide Association Study，简称MGWAS）是一种系统生物学方法，用于探索环境样本（如肠道微生物、土壤、水体等）或宿主共生微生物群落与特定表型（如疾病状态、生理指标、环境响应等）之间的关联关系。在MGWAS中，通过对大量样本进行高通量测序分析，获得宏基因组数据，进而揭示不同微生物种类及其功能基因在各种条件下的丰度变化，并寻找与特定表型显著相关的微生物标记物。 通过比较健康个体和患病个体的宏基因组数据，研究人员可以发现哪些微生物或者微生物功能特征与疾病的发生发展有关，从而为疾病的预防、诊断和治疗提供新的视角和策略。此外，MGWAS还可以应用于生态学、农业、工业发酵等多个领域，以期理解微生物群落在不同生态系统中的作用和功能机制。