创作中心
反馈咨询
欢迎添加微信!
微信号:z_gqing
微信二维码:

宏基因组测序数据分析流程-实战

1 宏基因组介绍 2 宏基因组测序数据质控-fastp软件 3 宏基因组测序去除宿主序列 4 宏基因组测序组装 5 宏基因组基因预测 6 非冗余基因集获取 7 基因集丰度 8 宏基因组物种注释 9 宏基因组测序Alpha多样性分析 10 宏基因组测序Beta多样性分析 10.1 PCA 10.2 PCOA 10.3 NMDS 11 LEfSe分析 12 ANOSIM 13 宏基因组测序功能注释 14 宏基因组测序的通路富集分析 15 宏基因组关联研究(MGWAS) 16 群落结构与环境因子的相关性分析
首页 教程 宏基因组测序数据分析流程-实战 ANOSIM
ANOSIM (Analysis of Similarities) 是一种非参数统计方法,用于分析群组间的相似性或差异性。在生态学、海洋学、生物信息学等领域中广泛应用,尤其适用于研究样本是否可以被显著地划分到不同的群组(如不同处理组、不同地点、不同时间点等)。 在实际操作中,ANOSIM首先计算所有样本之间的距离或相似度矩阵,然后将这些相似性得分与样本所属群组标签相结合,通过计算R值(范围在-1到1之间)来评估群组间的差异程度。R值接近1表示群组间差异显著,而接近0则表示群组间无显著差异。同时,该方法还会给出一个p值,用于判断这种群组间的差异是否具有统计学意义。

官方微信
点击收藏 编辑日记
木牛零码 Newmer生信 公司产品 意见反馈 联系我们 关于我们 招合伙-招聘-兼职
Copyright © 2021-2024 上海牛马人生物科技有限公司 沪ICP备 2022007390号-2