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单细胞拟时序分析

1 单细胞拟时序分析的基础概念 1.1 单细胞测序技术的概述 1.2 单细胞测序数据的特点和挑战 1.3 拟时序分析的基本原理和目标 2 单细胞测序数据处理 2.1 单细胞测序数据质量控制与过滤 2.2 单细胞转录组定量与归一化 2.3 细胞聚类与亚群识别 2.4 差异基因表达分析 2.5 单细胞数据可视化 3 拟时序分析方法 3.1 基于谱系推断的方法 3.1.1 Palantir 3.1.2 Wanderlust 3.1.3 Wishbone 3.2 基于伪时间轴构建的方法 3.2.1 Monocle 3.2.2 Slingshot 3.3 基于机器学习的时间预测模型 3.3.1 TSCAN 3.3.2 SCIMITAR 3.4 其他方法介绍 3.4.1 Waterfall 3.4.2 URD 4 应用案例 4.1 发育过程中的拟时序分析 4.2 疾病进展过程中的拟时序分析 4.3 细胞分化路径的研究 4.4 药物反应过程的动态模拟 5 单细胞拟时序分析实践操作 5.1 单细胞拟时序分析的数据准备与预处理 5.2 选择合适的拟时序分析工具 5.3 运行拟时序分析 5.4 单细胞拟时序分析的结果解读与可视化 5.5 单细胞拟时序分析的验证与优化 6 单细胞拟时序分析的最新研究进展 6.1 新兴的单细胞测序技术 6.2 拟时序分析的新方法 6.3 拟时序分析在不同领域的应用 7 单细胞拟时序分析的学习资源推荐 7.1 单细胞拟时序分析的文献阅读推荐 7.2 单细胞拟时序分析的在线课程推荐 7.3 单细胞拟时序分析的论坛和社区推荐
首页 教程 单细胞拟时序分析 单细胞拟时序分析的文献阅读推荐
单细胞拟时序分析是一种通过观察和比较不同细胞在时间序列上的变化来理解生物学过程的方法。这种方法可以帮助我们了解基因表达、细胞分化和疾病发生等复杂过程的动态变化。 以下是一些关于单细胞拟时序分析的推荐文献: 1. "Pseudotime analysis of single-cell transcriptional dynamics":这篇综述文章详细介绍了单细胞拟时序分析的基本概念、方法和应用,并提供了许多实用的资源。 2. "Dynamics of lineage commitment from haematopoietic progenitors":这篇研究论文使用单细胞拟时序分析来研究造血干细胞向各种血细胞分化的动态过程。 3. "Reconstructing the sequence of events in a developing cell population using single-cell transcriptomics":这篇研究论文展示了如何使用单细胞拟时序分析来重建胚胎发育过程中细胞群体的变化。 4. "Reverse-engineering cellular trajectories from high-dimensional single-cell data":这篇研究论文提出了一种新的单细胞拟时序分析方法,可以更准确地预测细胞的发展轨迹。 5. "Single-cell RNA-seq reveals dynamic, random monoallelic gene expression in mammalian cells":这篇研究论文利用单细胞拟时序分析揭示了哺乳动物细胞中基因随机单等位基因表达的动力学特性。 这些文献不仅可以帮助你深入理解单细胞拟时序分析的基本原理和方法,还可以为你提供一些实际的应用案例和研究思路。

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