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单细胞转录组测序

1 单细胞转录组测序概述 1.1 单细胞转录组测序的定义和原理 1.2 单细胞转录组测序的应用领域 1.3 单细胞转录组测序的优势和挑战 2 单细胞分离技术 2.1 流式细胞术 2.2 微流控技术 2.3 激光捕获显微切割技术 2.4 其他单细胞分离技术 3 单细胞RNA测序技术 3.1 SMART-seq技术 3.2 Drop-seq技术 3.3 MARS-seq技术 3.4 其他单细胞RNA测序技术 4 单细胞数据处理流程 4.1 单细胞数据质量控制 4.2 转录本比对与定量 4.3 细胞质性过滤 4.4 单细胞数据标准化与归一化 4.5 分析差异表达基因 5 单细胞聚类分析 5.1 单细胞基于距离的聚类方法 5.2 单细胞基于密度的聚类方法 5.3 单细胞基于模型的聚类方法 5.4 单细胞聚类结果评估与可视化 6 单细胞轨迹分析 6.1 基于伪时间推移的轨迹构建 6.2 Monocle算法 6.3 Wanderlust算法 6.4 SCUBA算法 7 单细胞功能注释与通路富集分析 7.1 GO功能注释 7.2 KEGG通路富集分析 7.3 Reactome通路富集分析 8 单细胞数据分析工具介绍 8.1 Seurat 8.2 Scanpy 9 单细胞转录组测序案例分析 9.1 单细胞转录组测序在神经科学应用案例 9.2 单细胞转录组测序在癌症研究应用案例 9.3 单细胞转录组测序在免疫学应用案例 10 单细胞转录组测序未来发展趋势 10.1 单细胞转录组测序技术创新方向 10.2 单细胞转录组测序应用领域拓展 10.3 单细胞转录组测序数据共享与整合
首页 教程 单细胞转录组测序 单细胞轨迹分析
单细胞轨迹分析是一种研究单个细胞如何随着时间的推移而变化的方法。这种方法可以用来研究细胞分化、发育和疾病发生的过程。 在单细胞轨迹分析中,首先需要对大量的单个细胞进行测序,并收集每个细胞的基因表达数据。然后使用机器学习算法来分析这些数据,以确定细胞之间的相似性和差异性,并构建一个细胞演化树或轨迹图。这个轨迹图展示了细胞如何从一个状态转变为另一个状态,并且可以帮助研究人员理解细胞分化和发育的过程。 单细胞轨迹分析的应用非常广泛,包括但不限于生物学、医学、药学和生物技术等领域。它可以帮助科学家们更好地了解细胞行为和功能,以及它们如何响应环境和遗传因素的影响。此外,它还可以为疾病的预防和治疗提供新的思路和策略。

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