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单细胞转录组测序

1 单细胞转录组测序概述 1.1 单细胞转录组测序的定义和原理 1.2 单细胞转录组测序的应用领域 1.3 单细胞转录组测序的优势和挑战 2 单细胞分离技术 2.1 流式细胞术 2.2 微流控技术 2.3 激光捕获显微切割技术 2.4 其他单细胞分离技术 3 单细胞RNA测序技术 3.1 SMART-seq技术 3.2 Drop-seq技术 3.3 MARS-seq技术 3.4 其他单细胞RNA测序技术 4 单细胞数据处理流程 4.1 单细胞数据质量控制 4.2 转录本比对与定量 4.3 细胞质性过滤 4.4 单细胞数据标准化与归一化 4.5 分析差异表达基因 5 单细胞聚类分析 5.1 单细胞基于距离的聚类方法 5.2 单细胞基于密度的聚类方法 5.3 单细胞基于模型的聚类方法 5.4 单细胞聚类结果评估与可视化 6 单细胞轨迹分析 6.1 基于伪时间推移的轨迹构建 6.2 Monocle算法 6.3 Wanderlust算法 6.4 SCUBA算法 7 单细胞功能注释与通路富集分析 7.1 GO功能注释 7.2 KEGG通路富集分析 7.3 Reactome通路富集分析 8 单细胞数据分析工具介绍 8.1 Seurat 8.2 Scanpy 9 单细胞转录组测序案例分析 9.1 单细胞转录组测序在神经科学应用案例 9.2 单细胞转录组测序在癌症研究应用案例 9.3 单细胞转录组测序在免疫学应用案例 10 单细胞转录组测序未来发展趋势 10.1 单细胞转录组测序技术创新方向 10.2 单细胞转录组测序应用领域拓展 10.3 单细胞转录组测序数据共享与整合
首页 教程 单细胞转录组测序 其他单细胞分离技术
除了流式细胞术,还有一些其他的单细胞分离技术,如激光捕获显微切割、磁珠分选、微流控技术等。 1. 激光捕获显微切割:这是一种基于光学原理的单细胞分离技术。通过使用激光将目标细胞从组织切片中精确地切割出来,然后收集这些切割出来的细胞进行进一步的研究。这种方法的优点是能够对特定的细胞类型进行选择性分离,而且可以保持细胞的完整性,适合于研究细胞间的相互作用和细胞在组织中的定位。 2. 磁珠分选:这种技术是利用抗体与细胞表面抗原特异性结合的原理,先用带有特定抗体的磁珠标记目标细胞,然后通过磁场的作用将标记的细胞分离出来。这种方法的优点是可以实现高通量的细胞分离,适用于大规模的细胞筛选和分选。 3. 微流控技术:这是一种利用微尺度流体动力学原理来操纵和分离单个细胞的技术。通过设计微小的通道和结构,可以在微流控芯片上实现细胞的捕获、分离、培养和分析等功能。这种方法的优点是操作精度高,且能够在微小的样本量下进行细胞分离,适合于研究稀有细胞或少量细胞。 以上就是一些常见的单细胞分离技术,每种技术都有其特点和适用范围,可以根据实际需求选择合适的方法。

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