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单细胞转录组测序

1 单细胞转录组测序概述 1.1 单细胞转录组测序的定义和原理 1.2 单细胞转录组测序的应用领域 1.3 单细胞转录组测序的优势和挑战 2 单细胞分离技术 2.1 流式细胞术 2.2 微流控技术 2.3 激光捕获显微切割技术 2.4 其他单细胞分离技术 3 单细胞RNA测序技术 3.1 SMART-seq技术 3.2 Drop-seq技术 3.3 MARS-seq技术 3.4 其他单细胞RNA测序技术 4 单细胞数据处理流程 4.1 单细胞数据质量控制 4.2 转录本比对与定量 4.3 细胞质性过滤 4.4 单细胞数据标准化与归一化 4.5 分析差异表达基因 5 单细胞聚类分析 5.1 单细胞基于距离的聚类方法 5.2 单细胞基于密度的聚类方法 5.3 单细胞基于模型的聚类方法 5.4 单细胞聚类结果评估与可视化 6 单细胞轨迹分析 6.1 基于伪时间推移的轨迹构建 6.2 Monocle算法 6.3 Wanderlust算法 6.4 SCUBA算法 7 单细胞功能注释与通路富集分析 7.1 GO功能注释 7.2 KEGG通路富集分析 7.3 Reactome通路富集分析 8 单细胞数据分析工具介绍 8.1 Seurat 8.2 Scanpy 9 单细胞转录组测序案例分析 9.1 单细胞转录组测序在神经科学应用案例 9.2 单细胞转录组测序在癌症研究应用案例 9.3 单细胞转录组测序在免疫学应用案例 10 单细胞转录组测序未来发展趋势 10.1 单细胞转录组测序技术创新方向 10.2 单细胞转录组测序应用领域拓展 10.3 单细胞转录组测序数据共享与整合
首页 教程 单细胞转录组测序 激光捕获显微切割技术
激光捕获显微切割技术(Laser Capture Microdissection, LCM)是一种精确的组织细胞分离技术,主要应用于生物学和医学研究中。该技术通过使用激光将特定的细胞或组织区域从载玻片上切割下来,从而实现对特定细胞或组织的研究。 具体来说,LCM的工作流程如下: 1. 制备样本:首先需要将生物样本(如组织切片、细胞涂片等)固定在载玻片上,并进行染色处理,以便于在显微镜下观察和识别目标细胞或组织。 2. 显微观察:通过显微镜观察样本,确定要切割的目标细胞或组织区域。 3. 激光切割:利用激光束照射到目标细胞或组织区域,使该区域的薄层组织瞬间蒸发,与周围的组织分离。 4. 收集切割物:被切割下来的细胞或组织会粘附在一个特殊的收集装置上,然后可以将其取下进行后续的分子生物学分析,如基因表达谱分析、蛋白质组学分析等。 LCM技术的优点在于其高精度和高选择性,可以精准地从复杂的组织环境中分离出特定的细胞或组织区域,这对于研究疾病的发生发展机制、寻找疾病的生物标志物以及开发新的治疗方法具有重要意义。

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