宏基因组学（Metagenomics）是一种研究环境样品中所有微生物遗传物质的学科。它包括了对样本中的DNA和RNA进行测序、组装和分析，以了解环境中微生物群落的组成、功能和相互作用。
宏基因组学的历史可以追溯到20世纪90年代初，当时科学家们开始使用分子生物学技术来研究环境中微生物的多样性。然而，由于技术限制，这些早期的研究主要集中在单个物种或少数几个物种上。
随着高通量测序技术的发展，宏基因组学在21世纪初得到了迅速发展。2004年，一项里程碑式的研究发表在《科学》杂志上，该研究通过宏基因组学方法揭示了深海热液喷口生态系统中微生物的多样性。这一发现引发了广泛的关注，并推动了宏基因组学领域的发展。
自那以后，宏基因组学已经成为微生物生态学、环境科学、医学和生物工程等多个领域的核心研究工具。宏基因组学的应用范围不断扩大，从最初的环境样品扩展到了人体肠道微生物、土壤微生物、水体微生物等众多领域。同时，宏基因组学的技术也在不断发展和完善，例如长读长测序技术、单细胞测序技术等，为宏基因组学研究提供了更多的可能性。
