创作中心
反馈咨询
欢迎添加微信!
微信号:z_gqing
微信二维码:

测序技术

1 测序技术的基本概念 1.1 DNA、RNA和蛋白质的结构与功能 1.2 核酸序列的基本知识 1.3 测序技术的发展历程 2 第一代测序技术(Sanger测序) 2.1 Sanger测序原理 2.2 第一代测序的实验步骤及注意事项 2.3 第一代测序的应用实例与局限性 3 第二代测序技术(高通量测序) 3.1 高通量测序的基本原理 3.2 主要的第二代测序平台介绍(Illumina、Ion Torrent、454等) 3.3 第二代测序技术的实验设计及数据分析流程 3.4 第二代测序技术的应用实例与局限性 4 第三代测序技术(单分子测序) 4.1 单分子测序的基本原理 4.2 主要的第三代测序平台介绍(PacBio、Oxford Nanopore等) 4.3 第三代测序技术的实验设计及数据分析流程 4.4 第三代测序技术的应用实例与局限性 5 第四代测序技术 5.1 第四代测序技术的基本原理 5.2 主要的第四代测序平台介绍 5.3 第四代测序技术实验设计及数据分析流程 5.4 第四代测序技术应用前景与挑战 6 测序数据的质量控制与预处理 6.1 测序数据质量评估指标 6.2 测序数据质量过滤方法 6.3 测序数据预处理工具与软件 7 测序数据分析 7.1 测序数据变异检测 7.2 测序数据基因表达分析 7.3 转录组组装 7.4 其他常见分析任务(如ChIP-seq、ATAC-seq等) 8 生物信息学在测序技术中的应用 8.1 常用生物信息学数据库 8.2 生物信息学工具与软件 8.3 生物信息学在测序技术中的具体应用案例 9 测序技术在各领域的应用 9.1 测序技术在医学领域应用(遗传疾病诊断、癌症研究等) 9.2 测序技术在农业领域应用(作物育种、病虫害防治等) 9.3 测序技术在环境科学应用(微生物多样性研究等) 9.4 测序技术在其他领域应用(古生物学、进化生物学等) 10 测序技术未来发展趋势 10.1 新型测序技术的研发进展 10.2 大数据分析与人工智能的应用前景 10.3 测序技术对生命科学研究的影响
首页 教程 测序技术 常用生物信息学数据库
生物信息学数据库是存储和管理生物数据的重要工具,包括基因组序列、蛋白质结构、基因表达数据、分子相互作用等。以下是常用的生物信息学数据库: 1. NCBI(National Center for Biotechnology Information):由美国国立卫生研究院下属的国家医学图书馆维护,提供大量的生物信息资源,包括GenBank(基因序列数据库)、PubMed(生物医学文献数据库)、OMIM(人类孟德尔遗传病数据库)等。 2. Ensembl:由欧洲生物信息研究所和威康信托基金会桑格研究所共同维护,提供了大量基因组注释信息和比较基因组学数据。 3. UCSC(University of California, Santa Cruz)基因组浏览器:提供了多个物种的基因组序列和注释信息,并且有强大的可视化功能。 4. Protein Data Bank(PDB):是全球最大的三维生物大分子结构数据库,包含了蛋白质、核酸、复合物等多种类型的结构数据。 5. KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes):除了提供基因和蛋白质信息外,还提供了丰富的代谢通路和信号转导通路信息。 6. Reactome:是一个详细描述细胞生物学过程的数据库,如信号转导、细胞周期调控、代谢等。 7. STRING:是一个蛋白质-蛋白质相互作用数据库,包含了实验验证和预测的相互作用信息。 8. Gene Ontology(GO):是一种对基因和基因产品进行功能注释的标准方式,包括分子功能、细胞组件和生物学过程三个方面。 9. UniProt:是整合了Swiss-Prot、TrEMBL和PIR三个蛋白质数据库的综合资源,提供了详细的蛋白质功能注释。 以上只是生物信息学数据库的一部分,实际上还有许多其他的数据库,分别针对不同的生物信息学问题。

官方微信
点击收藏 编辑日记
木牛零码 Newmer生信 公司产品 意见反馈 联系我们 关于我们 招合伙-招聘-兼职
Copyright © 2021-2024 上海牛马人生物科技有限公司 沪ICP备 2022007390号-2