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测序技术

1 测序技术的基本概念 1.1 DNA、RNA和蛋白质的结构与功能 1.2 核酸序列的基本知识 1.3 测序技术的发展历程 2 第一代测序技术(Sanger测序) 2.1 Sanger测序原理 2.2 第一代测序的实验步骤及注意事项 2.3 第一代测序的应用实例与局限性 3 第二代测序技术(高通量测序) 3.1 高通量测序的基本原理 3.2 主要的第二代测序平台介绍(Illumina、Ion Torrent、454等) 3.3 第二代测序技术的实验设计及数据分析流程 3.4 第二代测序技术的应用实例与局限性 4 第三代测序技术(单分子测序) 4.1 单分子测序的基本原理 4.2 主要的第三代测序平台介绍(PacBio、Oxford Nanopore等) 4.3 第三代测序技术的实验设计及数据分析流程 4.4 第三代测序技术的应用实例与局限性 5 第四代测序技术 5.1 第四代测序技术的基本原理 5.2 主要的第四代测序平台介绍 5.3 第四代测序技术实验设计及数据分析流程 5.4 第四代测序技术应用前景与挑战 6 测序数据的质量控制与预处理 6.1 测序数据质量评估指标 6.2 测序数据质量过滤方法 6.3 测序数据预处理工具与软件 7 测序数据分析 7.1 测序数据变异检测 7.2 测序数据基因表达分析 7.3 转录组组装 7.4 其他常见分析任务(如ChIP-seq、ATAC-seq等) 8 生物信息学在测序技术中的应用 8.1 常用生物信息学数据库 8.2 生物信息学工具与软件 8.3 生物信息学在测序技术中的具体应用案例 9 测序技术在各领域的应用 9.1 测序技术在医学领域应用(遗传疾病诊断、癌症研究等) 9.2 测序技术在农业领域应用(作物育种、病虫害防治等) 9.3 测序技术在环境科学应用(微生物多样性研究等) 9.4 测序技术在其他领域应用(古生物学、进化生物学等) 10 测序技术未来发展趋势 10.1 新型测序技术的研发进展 10.2 大数据分析与人工智能的应用前景 10.3 测序技术对生命科学研究的影响
首页 教程 测序技术 第一代测序技术(Sanger测序)
第一代测序技术,也称为Sanger测序,是由英国生物化学家Frederick Sanger在1977年发明的。这种技术是基于链终止原理,通过逐步添加核苷酸到正在扩增的DNA链中,直到到达特定的停止点为止。这些停止点是由于加入了一种特殊的dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸),它含有一个荧光标记和一个无法继续延伸的羟基。 在Sanger测序中,通常会同时进行四个不同的反应,每个反应都使用一种不同的特殊dNTP。这样,在每个反应结束时,就会得到一组长度不同的DNA片段,它们分别代表了原始DNA序列的不同部分。然后,可以通过凝胶电泳将这些片段分离,并通过检测它们的荧光标记来确定它们的大小和顺序。 虽然Sanger测序可以提供高质量的DNA序列数据,但它也有一些限制。例如,它需要大量的起始DNA,并且一次只能分析一个样本。此外,对于大型基因组或复杂样品,Sanger测序可能需要很长时间和高昂的成本。因此,尽管Sanger测序仍然是某些应用中的金标准,但现在已经逐渐被高通量测序技术所取代。

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