1. NCBI(National Center for Biotechnology Information):NCBI是美国国立卫生研究院下属的一个机构,提供了大量的生物信息学资源,包括基因组、蛋白质、核酸序列等数据。其中最著名的是GenBank数据库,包含了全球公开的DNA和RNA序列。此外,还有PubMed文献数据库,提供生命科学领域的文献检索服务。
2. Ensembl:Ensembl是一个由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)和威康信托桑格研究所联合开发的生物信息学数据库,主要关注真核生物的基因组注释。它提供了丰富的基因组、转录本、蛋白质和变异等数据,并且有强大的在线分析工具。
3. UniProt:UniProt是由瑞士生物信息学研究所、欧洲生物信息学研究所和美国国家生物技术信息中心合作维护的蛋白质数据库。UniProt包含了大量的蛋白质序列和功能信息,如蛋白质结构、亚细胞定位、翻译后修饰、疾病关联等。
4. KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes):KEGG是一个综合性的生物信息学数据库,不仅包含基因和蛋白质的信息,还包含了生物通路、药物信息等内容。用户可以通过KEGG进行基因功能分析、通路分析等。
5. STRING(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins):STRING是一个专门用于预测和分析蛋白质间相互作用的数据库,可以为研究者提供关于蛋白质功能、通路和网络的深入理解。
6. dbSNP(Single Nucleotide Polymorphism Database):dbSNP是NCBI维护的一个单核苷酸多态性数据库,收集了来自全球各地的SNP信息,对于遗传病研究和个体化医疗具有重要价值。
7. PDB(Protein Data Bank):PDB是由全球科研人员共同维护的蛋白质三维结构数据库,提供了大量蛋白质、核酸和其他生物大分子的三维结构信息,对于理解生物学过程和设计药物具有重要作用。