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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
首页 教程 生物信息数据库 IntAct
IntAct是一个开放的、分子相互作用数据库,它提供了蛋白质-蛋白质相互作用的信息。这个数据库是由欧洲生物信息学研究所(EMBL-EBI)维护和管理的。 IntAct数据库中包含了大量实验验证的蛋白质-蛋白质相互作用数据,这些数据来自各种不同的研究,包括酵母双杂交、亲和纯化质谱等。每个交互都有详细的元数据,如实验方法、参与的蛋白质和它们的功能注释等。 此外,IntAct还支持复杂的查询功能,用户可以根据蛋白质名称、基因符号、UniProt ID、PubMed ID等多种方式进行查询,并可以下载查询结果。IntAct还提供了与其他重要生物信息学资源的链接,如Ensembl、UniProt、Reactome等。 总的来说,IntAct是一个非常有价值的工具,对于理解蛋白质网络和生物学过程具有重要的意义。

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