MetaCyc是一个生物化学数据库，它包含了广泛而详细的信息关于各种生物体内的代谢路径和反应。这个数据库是由美国索尔克生物研究所的生物信息学研究团队创建和维护的。
MetaCyc中的数据主要来源于公开发表的科学研究文献，以及由专家手动审查和整合的数据。该数据库的内容包括了数千种不同的代谢路径和反应，涉及到数百种不同的化合物和酶。
MetaCyc的一个重要特点是它的层次结构，这种结构使得用户可以以多种不同的方式来浏览和查询数据。例如，用户可以通过化合物、酶、途径或基因来查找信息。此外，MetaCyc还提供了强大的搜索功能，可以帮助用户快速找到他们感兴趣的数据。
MetaCyc被广泛用于生物学和生物医学研究中，特别是在代谢工程、系统生物学和药物发现等领域。许多科研机构和公司都使用MetaCyc作为他们的生物信息学工作的重要工具。
7.5 Human Metabolome Database (HMDB)
Human Metabolome Database (HMDB) 是一个在线数据库，提供了关于人体内所有已知代谢物的信息。这个数据库是由加拿大阿尔伯塔大学的研究人员开发的，并于2005年首次发布。
HMDB 包含了大量的数据和信息，包括代谢物的化学结构、生物化学性质、生源途径、功能、毒性和临床相关性等。此外，该数据库还包括了代谢物在不同组织、器官和体液中的浓度以及它们在健康和疾病状态下的变化情况。
HMDB 的一个重要特点是它的用户友好界面和强大的搜索功能。用户可以根据代谢物名称、分子式、CAS号、KEGG ID等多种方式来搜索所需的代谢物信息。此外，HMDB 还提供了一些高级搜索选项，如基于通路或疾病的搜索，这使得研究人员可以更方便地探索代谢物与特定生物学过程或疾病之间的关系。
HMDB 的数据来源于多个来源，包括公开发布的文献、实验数据和其它数据库。这些数据经过严格的审核和质量控制，以确保其准确性和可靠性。此外，HMDB 也接受来自研究社区的数据提交和反馈，以便持续更新和完善数据库内容。
总的来说，HMDB 是一个非常有价值的资源，对于理解人类代谢及其在健康和疾病中的作用具有重要的意义。
