KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的生物信息学数据库,旨在系统地分析基因功能和分子相互作用网络。它由日本京都大学的Kanehisa实验室开发和维护。
KEGG包含以下主要组成部分:
1. KEGG PATHWAY:这是KEGG的核心部分,提供了各种生物通路的信息,包括代谢途径、遗传信息处理、环境信息处理、细胞过程等。这些通路图是根据实验数据和文献资料构建的,并且可以进行计算机模拟。
2. KEGG BRITE:这是一个分类和超分类数据库,用于描述各种生物系统的层次结构,例如细胞组件、分子功能和生物过程。
3. KEGG MODULE:这是对生物系统中具有特定功能的模块化单位的描述,包括催化反应的酶复合物、信号转导单元等。
4. KEGG DISEASE:这个数据库收集了与人类疾病相关的基因和分子信息,以及疾病的分类和病因。
5. KEGG DRUG:这个数据库包含了药物及其相关分子的信息,如药物靶点、药效团和副作用等。
6. KEGG GENOME:这个数据库包含了各种物种的基因组信息,包括基因注释和基因组比较。
7. KEGG MEDICINE:这个数据库提供了一种基于化学-基因-蛋白质关系的药物发现和开发框架。
8. KEGG ENZYME:这个数据库包含了所有已知酶的详细信息,包括酶的名称、编号、结构、功能和反应机制等。
通过这些数据库,研究人员可以更好地理解基因和分子的功能,揭示生命现象的本质,为疾病的诊断和治疗提供新的思路。