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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
首页 教程 生物信息数据库 生物化学和代谢途径数据库
生物化学和代谢途径数据库是一个储存生物化学反应和代谢途径信息的数据库。这些数据库通常包含各种生物体的代谢网络图,以及有关代谢物、酶、基因和蛋白质的信息。这些数据库对于研究生物体内的代谢过程非常重要,可以帮助科学家们更好地理解生命现象,并为药物研发、疾病诊断和治疗提供帮助。 一些常用的生物化学和代谢途径数据库包括: - KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes): KEGG是一个综合性的数据库,其中包含了关于基因组、生物化学、代谢途径和其他生物学信息的数据。KEGG中的代谢途径数据可以用来分析生物体内的代谢过程,并预测不同条件下的代谢变化。 - Reactome: Reactome是一个专门关注人类代谢途径的数据库。它提供了详细的代谢途径图谱,并且还提供了相关的基因和蛋白质信息。Reactome的数据可以帮助研究人员了解人体内发生的代谢过程,并为疾病研究提供参考。 - MetaCyc: MetaCyc是一个大型的代谢途径数据库,其中包括了超过2000种微生物和植物的代谢途径信息。MetaCyc中的数据可以帮助研究人员了解不同生物体内的代谢过程,并为生物工程和合成生物学等领域提供支持。 除了以上几个数据库之外,还有很多其他的生物化学和代谢途径数据库,它们各有特点和优势。

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