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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
首页 教程 生物信息数据库 snoRNABase
snoRNABase是一个专门用于收集和整理小核仁RNA(Small Nucleolar RNA,简称snoRNA)信息的数据库。这个数据库由法国国家科学研究中心(CNRS)和巴黎第六大学共同维护。 snoRNA是一类主要存在于细胞核内的非编码RNA,它们在真核生物中广泛存在,参与rRNA的修饰过程,包括2'-O-甲基化和假尿苷化等。这些修饰对于rRNA的稳定性和功能至关重要,进而影响到核糖体的组装和功能。 snoRNABase数据库收集了来自多种物种的snoRNA序列信息,包括人类、小鼠、酵母等。每个snoRNA记录都包含了详细的序列信息、二级结构预测、相关的mRNA靶点以及相关的文献引用等。此外,该数据库还提供了方便用户进行序列搜索和比较的功能。 总的来说,snoRNABase是一个非常有价值的工具,为科研人员研究snoRNA的功能和作用机制提供了重要的数据支持。

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