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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
首页 教程 生物信息数据库 miRBase
miRBase是一个专门收录微小RNA(microRNA)序列和注释信息的数据库。它由英国剑桥大学威尔康信托研究所的格雷戈里·汉密尔顿实验室于2002年建立,是目前国际上最权威、最大的微小RNA数据库。 在miRBase中,每一种微小RNA都有一个唯一的miRBase ID,这个ID通常以"MI"开头,后面跟着四位数字。例如,人类中最常见的一种微小RNA,let-7a,在miRBase中的ID就是MI0000070。 除了微小RNA的序列信息外,miRBase还提供了微小RNA的预测靶基因、表达谱数据、二级结构等丰富的生物学信息。这些信息对于研究微小RNA的功能及其在疾病发生发展中的作用具有重要的参考价值。 此外,miRBase还提供了一些在线工具,如miRNA家族浏览器、miRNA搜索工具等,方便科研人员进行数据查询和分析。 总的来说,miRBase是微小RNA研究的重要资源库,为微小RNA的研究提供了强有力的支持。

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