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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
首页 教程 生物信息数据库 InterPro
InterPro是一个生物信息学数据库,它将多种蛋白质家族、域和功能站点的注释整合在一起。这个数据库的主要目的是为了提供一种全面且统一的方式来描述蛋白质的结构、功能和进化关系。 InterPro的构建是基于许多其他的数据库和预测方法,包括Pfam、PROSITE、PRINTS、SMART、TIGRFAMs、PIRSF等。这些数据库提供了关于蛋白质家族、域和功能位点的信息。通过整合这些资源,InterPro可以提供更完整和准确的蛋白质注释。 InterPro的使用非常广泛,包括在基因组注释、蛋白质分类、疾病研究、药物发现等领域。通过查询InterPro,研究人员可以快速了解一个蛋白质可能的功能和结构特征,这对于理解蛋白质的功能和生物学过程至关重要。 此外,InterPro还提供了一个图形用户界面,使得非专业的用户也可以方便地查询和浏览数据。同时,InterPro也提供了API和批量下载服务,以满足高级用户的需求。 总的来说,InterPro是一个非常重要的蛋白质注释资源,对于生物学和医学研究有着重要的作用。

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