SCOP（Structural Classification of Proteins）是一种蛋白质结构分类系统，它根据蛋白质的折叠模式、拓扑结构和氨基酸序列相似性将蛋白质结构进行分类。SCOP系统的设计目的是为了更好地理解蛋白质的进化关系和功能。
在SCOP系统中，蛋白质结构被分为四个层次：阶层、类、fold和超家族。每个层次都反映了蛋白质结构的不同特征和相似性。
1. 阶层：这是最高级别的分类，包括所有已知的蛋白质结构。在这个级别上，蛋白质被分为所有-α、所有-β、α/β、α+β和多结构域蛋白质等类别。
2. 类：这个级别的分类基于蛋白质的二级结构元素（α螺旋和β片层）的排列方式。例如，所有的α螺旋蛋白质被分为一个类，所有的β片层蛋白质被分为另一个类。
3. Fold：这个级别的分类是基于蛋白质的三维结构，特别是主链的构象。Fold通常被认为是蛋白质结构的基本单位，因为它包含了蛋白质的功能区域。
4. 超家族：这个级别的分类是基于蛋白质的氨基酸序列相似性。如果两个蛋白质的序列相似度超过一定阈值，并且它们的fold也相同，那么它们就被认为属于同一个超家族。
总的来说，SCOP系统提供了一种全面而详细的方法来描述和比较蛋白质结构，这对于理解蛋白质的功能和进化非常重要。
