除了我们之前提到的几个主要的基因组数据库,如NCBI、Ensembl和UCSC,还有许多其他的基因组数据库,它们各自有着不同的特点和应用领域。
1. DNA Data Bank of Japan (DDBJ):日本的DNA数据银行,是全球三大基因序列数据库之一,与NCBI和EBI共享数据。DDBJ提供了大量的核酸序列信息,包括DNA、RNA和蛋白质序列。
2. European Nucleotide Archive (ENA):欧洲核苷酸档案库,由EMBL-EBI维护。它是一个收集和存档所有类型的核酸序列数据的数据库,包括测序数据、组装的基因组、转录本等。
3. VectorBase:这是一个专门针对寄生虫和其他节肢动物的基因组数据库,特别关注疟疾、丝虫病和登革热等疾病的传播媒介。
4. FlyBase:这是果蝇(Drosophila melanogaster)的模型生物数据库,包含了关于果蝇基因组、基因表达、发育和遗传变异的信息。
5. WormBase:线虫(Caenorhabditis elegans)的模型生物数据库,提供了关于线虫基因组、基因功能、发育和表型的数据。
6. ZFIN:斑马鱼(Danio rerio)的模型生物数据库,包含了关于斑马鱼基因组、基因表达、发育和遗传变异的信息。
7. Gramene:专注于草类植物基因组学的研究,特别是粮食作物和能源作物,如水稻、小麦、玉米和甘蔗。
8. Arabidopsis Information Resource (TAIR):拟南芥(Arabidopsis thaliana)的模型生物数据库,提供了关于拟南芥基因组、基因功能、发育和表型的数据。
这些数据库都是研究基因组学的重要资源,可以为科学家提供大量的信息和工具,帮助他们理解和解析基因组的功能和结构。