Ensembl是一个开放源码的生物信息学项目,由欧洲生物信息研究所(EMBL-EBI)和威康桑格研究所共同维护。它的主要目标是为科学家提供一个全面、最新的基因组注释和比较基因组学数据的平台。
Ensembl的核心功能包括基因识别、基因结构预测、蛋白质编码、非编码RNA的识别和注释等。它提供了大量的基因和蛋白质的功能信息,以及基因在不同物种之间的同源性信息。此外,Ensembl还提供了强大的数据查询和分析工具,如BLAST、BlastView、VEP等。
Ensembl数据库覆盖了大量物种的基因组,包括人类、小鼠、大鼠、果蝇、线虫、斑马鱼、鸡、狗、猪、牛、兔、猫、猴、骆驼、袋鼠、鸭嘴兽等多种模式生物和重要经济动物。对于每个物种,Ensembl都会提供详细的基因组注释信息,包括基因的位置、结构、表达水平、功能注释等。
总的来说,Ensembl是一个非常重要的生物信息学资源,对于生物学研究,特别是基因组学和转录组学研究具有极大的价值。