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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
首页 教程 生物信息数据库 NCBI基因组数据库
NCBI基因组数据库是美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,简称NCBI)提供的一个全面的、开放的基因组序列数据库。该数据库包含了来自各种生物的基因组数据,包括人类、其他动物、植物、微生物等。 在NCBI基因组数据库中,用户可以查询到基因组的全序列信息,也可以找到关于基因、蛋白质、转录本、CDS(Coding Sequence)、SNP(Single Nucleotide Polymorphism)等各种生物学功能单位的信息。此外,数据库还提供了基因组注释信息,包括基因的位置、结构和功能预测等。 NCBI基因组数据库不仅为科研人员提供了大量的基因组数据资源,也为临床医生、生物技术和制药公司等提供了一个重要的信息平台。通过这个数据库,研究人员可以方便地获取和分析基因组数据,从而推动生物学和医学领域的发展。

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