Cytoscape是一款开源的生物信息学软件，主要用于可视化和分析分子相互作用网络。这款软件允许用户通过图形界面来操作和分析复杂的数据网络，例如蛋白质-蛋白质相互作用网络、基因调控网络、信号转导网络等。
Cytoscape的核心功能包括：
1. 网络构建：用户可以导入或手动创建网络，支持多种格式的数据输入。
2. 网络布局：提供多种布局算法，帮助用户以直观的方式展示网络结构。
3. 数据可视化：支持丰富的视觉属性，如节点大小、颜色、形状，边的样式等，可以根据数据的特性进行定制。
4. 数据分析：内置了多种网络分析工具，如中心性分析、模块化分析、路径搜索等。
5. 扩展性强：提供了API接口，用户可以通过编程方式扩展其功能，同时也有大量的插件可供选择。
6. 社区活跃：拥有庞大的用户社区，定期发布新版本和更新，用户可以方便地获取技术支持和分享使用经验。
Cytoscape在生物学研究中有着广泛的应用，可以帮助研究人员从复杂的分子相互作用中发现关键的调控机制，也可以用于疾病的分子机制研究，药物靶点预测等。
