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生物信息数据库

1 生物信息学概述 1.1 生物信息学定义和历史 1.2 生物信息学的应用领域 2 基因组学数据库 2.1 NCBI基因组数据库 2.1.1 GenBank 2.1.2 RefSeq 2.1.3 dbSNP 2.2 Ensembl 2.3 UCSC基因组浏览器 2.4 EMBL-EBI基因组资源 2.5 其他基因组数据库 3 蛋白质序列和结构数据库 3.1 UniProt 3.2 Pfam 3.3 SMART 3.4 CATH 3.5 SCOP 3.6 InterPro 4 非编码RNA数据库 4.1 miRBase 4.2 piRNABank 4.3 snoRNABase 4.4 Lncipedia 4.5 Rfam 5 表观遗传学数据库 5.1 ENCODE 6 微生物数据库 6.1 NCBI微生物数据库 7 生物化学和代谢途径数据库 7.1 KEGG 7.2 Reactome 7.3 BioCyc 7.4 MetaCyc 8 医学和临床数据库 9 分子互作数据库 9.1 STRING 9.2 IntAct 9.3 MINT 9.4 BioGRID 9.5 iRefIndex 10 生物医学文献数据库 10.1 PubMed 10.2 Scopus 11 数据挖掘和分析工具 11.1 BLAST 11.2 HMMER 11.3 MAFFT 11.4 Jalview 11.5 Cytoscape 11.6 Galaxy 12 生物信息学软件和编程语言 12.1 R语言 12.2 Python 12.3 Perl 12.4 Biopython 12.5 Bioconductor
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生物医学文献数据库是一种专门为生物医学领域研究者提供的信息资源,用于存储、管理和检索与生物医学相关的学术文献。这些数据库包含了大量的科学论文、期刊文章、会议记录、书籍、实验数据等,涵盖了生物学、医学、药学、遗传学、神经科学等多个学科。 使用生物医学文献数据库可以帮助科研人员快速找到自己需要的信息,提高研究效率。此外,这些数据库还提供了各种工具和功能,如引文索引、摘要浏览、全文下载等,方便用户进行深入的研究和分析。 常见的生物医学文献数据库包括PubMed、Web of Science、Embase、Scopus等。这些数据库的收录范围、更新频率、搜索功能等方面存在一定的差异,因此在使用时应根据自己的需求选择合适的数据库。

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