创作中心
反馈咨询
欢迎添加微信!
微信号:z_gqing
微信二维码:

蛋白质组学

1 蛋白质组学基础 1.1 蛋白质概述 1.1.1 蛋白质的定义与分类 1.1.2 蛋白质的结构层次 1.1.3 蛋白质的功能和重要性 1.2 蛋白质组的概念与研究内容 1.2.1 蛋白质组的定义 1.2.2 蛋白质组的研究目标 1.2.3 蛋白质组研究的主要领域 1.3 蛋白质组学的发展历程与应用前景 1.3.1 蛋白质组学的历史沿革 1.3.2 蛋白质组学的应用现状 1.3.3 蛋白质组学的未来发展趋势 2 蛋白质组学技术方法 2.1 蛋白质分离与纯化技术 2.1.1 蛋白质提取方法 2.1.2 蛋白质分离技术(如:电泳、色谱法等) 2.2 蛋白质鉴定与定量技术 2.2.1 蛋白质鉴定技术(如:质谱分析、酶切鉴定等) 2.2.2 蛋白质定量技术(如:同位素标记、荧光染料标记等) 2.3 功能蛋白质组学技术 2.3.1 结构生物学技术(如:X射线晶体衍射、核磁共振等) 2.3.2 互作蛋白质组学技术(如:酵母双杂交、pull-down等) 2.4 系统蛋白质组学技术 2.4.1 生物信息学在蛋白质组学中的应用 2.4.2 大规模数据处理与分析技术 3 蛋白质组学实验设计与数据分析 3.1 蛋白质组学实验设计原则与策略 3.1.1 蛋白质组学实验样本选择与采集 3.1.2 蛋白质组学实验对照设置 3.1.3 蛋白质组学实验技术路线的选择 3.2 蛋白质组数据质量控制与预处理 3.2.1 蛋白质组数据质量控制之噪声消除与缺失值填充 3.2.2 蛋白质组数据质量控制之数据标准化与归一化 3.3 蛋白质差异表达分析 3.3.1 蛋白质差异表达分析之定量数据统计分析方法 3.3.2 蛋白质差异表达分析之差异蛋白筛选标准与阈值设定 3.4 蛋白质功能注释与富集分析 3.4.1 GO注释与KEGG通路分析 3.4.2 蛋白质相互作用网络构建与分析 3.5 蛋白质组结果解释与报告撰写 3.5.1 蛋白质组结果可视化方法 3.5.2 蛋白质组结论总结与讨论 4 特定领域的蛋白质组学应用 4.1 医学生物学 4.1.1 肿瘤蛋白质组学 4.1.2 心血管疾病蛋白质组学 4.1.3 免疫系统蛋白质组学 4.2 农业生物技术 4.2.1 植物蛋白质组学 4.2.2 动物蛋白质组学 4.3 微生物蛋白质组学 4.3.1 细菌蛋白质组学 4.3.2 真菌蛋白质组学 5 蛋白质组学最新进展与前沿动态 5.1 单细胞蛋白质组学 5.2 蛋白质翻译后修饰组学 5.3 蛋白质动力学研究 6 蛋白质组学伦理与法规 6.1 生物样本库管理规范 6.2 蛋白质组学研究中的隐私保护 6.3 蛋白质组学研究中的知识产权保护
首页 教程 蛋白质组学 蛋白质差异表达分析之差异蛋白筛选标准与阈值设定
蛋白质差异表达分析是生物信息学中的一个重要研究方向,主要目的是通过比较不同样本中蛋白质的表达量,筛选出具有显著性差异的蛋白质。这种差异可能与疾病的发生、发展或者治疗反应等生物学现象密切相关。 在进行蛋白质差异表达分析时,需要设定一些筛选标准和阈值,以便准确地识别出差异蛋白。以下是一些常用的筛选标准和阈值设定方法: 1. 检验统计量:最常用的检验统计量是t检验或Fisher's exact test。这些统计量可以帮助我们判断两个样本之间的蛋白质表达量是否有显著差异。 2. 显著性水平:显著性水平通常设置为0.05或0.01,这意味着我们愿意接受5%或1%的错误率,即有5%或1%的可能性我们会把没有差异的蛋白质误判为有差异的蛋白质。 3. 差异倍数:除了考虑显著性水平外,还需要考虑差异倍数。例如,我们可以设定一个阈值,只有当一个蛋白质在两个样本中的表达量差异超过这个阈值时,才认为这个蛋白质是差异蛋白。 4. 多重假设检验校正:由于我们在同一组数据中进行了多次检验(每个蛋白质都进行了一次检验),所以需要进行多重假设检验校正,以控制错误发现率。常用的校正方法包括Bonferroni校正、Benjamini-Hochberg校正等。 总的来说,蛋白质差异表达分析的筛选标准和阈值设定是一个复杂的过程,需要根据具体的研究问题和数据特性来确定。

官方微信
点击收藏 编辑日记
木牛零码 Newmer生信 公司产品 意见反馈 联系我们 关于我们 招合伙-招聘-兼职
Copyright © 2021-2024 上海牛马人生物科技有限公司 沪ICP备 2022007390号-2