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蛋白质组学

1 蛋白质组学基础 1.1 蛋白质概述 1.1.1 蛋白质的定义与分类 1.1.2 蛋白质的结构层次 1.1.3 蛋白质的功能和重要性 1.2 蛋白质组的概念与研究内容 1.2.1 蛋白质组的定义 1.2.2 蛋白质组的研究目标 1.2.3 蛋白质组研究的主要领域 1.3 蛋白质组学的发展历程与应用前景 1.3.1 蛋白质组学的历史沿革 1.3.2 蛋白质组学的应用现状 1.3.3 蛋白质组学的未来发展趋势 2 蛋白质组学技术方法 2.1 蛋白质分离与纯化技术 2.1.1 蛋白质提取方法 2.1.2 蛋白质分离技术(如:电泳、色谱法等) 2.2 蛋白质鉴定与定量技术 2.2.1 蛋白质鉴定技术(如:质谱分析、酶切鉴定等) 2.2.2 蛋白质定量技术(如:同位素标记、荧光染料标记等) 2.3 功能蛋白质组学技术 2.3.1 结构生物学技术(如:X射线晶体衍射、核磁共振等) 2.3.2 互作蛋白质组学技术(如:酵母双杂交、pull-down等) 2.4 系统蛋白质组学技术 2.4.1 生物信息学在蛋白质组学中的应用 2.4.2 大规模数据处理与分析技术 3 蛋白质组学实验设计与数据分析 3.1 蛋白质组学实验设计原则与策略 3.1.1 蛋白质组学实验样本选择与采集 3.1.2 蛋白质组学实验对照设置 3.1.3 蛋白质组学实验技术路线的选择 3.2 蛋白质组数据质量控制与预处理 3.2.1 蛋白质组数据质量控制之噪声消除与缺失值填充 3.2.2 蛋白质组数据质量控制之数据标准化与归一化 3.3 蛋白质差异表达分析 3.3.1 蛋白质差异表达分析之定量数据统计分析方法 3.3.2 蛋白质差异表达分析之差异蛋白筛选标准与阈值设定 3.4 蛋白质功能注释与富集分析 3.4.1 GO注释与KEGG通路分析 3.4.2 蛋白质相互作用网络构建与分析 3.5 蛋白质组结果解释与报告撰写 3.5.1 蛋白质组结果可视化方法 3.5.2 蛋白质组结论总结与讨论 4 特定领域的蛋白质组学应用 4.1 医学生物学 4.1.1 肿瘤蛋白质组学 4.1.2 心血管疾病蛋白质组学 4.1.3 免疫系统蛋白质组学 4.2 农业生物技术 4.2.1 植物蛋白质组学 4.2.2 动物蛋白质组学 4.3 微生物蛋白质组学 4.3.1 细菌蛋白质组学 4.3.2 真菌蛋白质组学 5 蛋白质组学最新进展与前沿动态 5.1 单细胞蛋白质组学 5.2 蛋白质翻译后修饰组学 5.3 蛋白质动力学研究 6 蛋白质组学伦理与法规 6.1 生物样本库管理规范 6.2 蛋白质组学研究中的隐私保护 6.3 蛋白质组学研究中的知识产权保护
首页 教程 蛋白质组学 互作蛋白质组学技术(如:酵母双杂交、pull-down等)
互作蛋白质组学技术是一种研究蛋白质间相互作用的技术,它在生物科学领域中具有重要作用。这些技术可以帮助科学家了解蛋白质的功能、结构和相互作用网络,从而揭示生命现象的本质。 1. 酵母双杂交技术:这是一种常用的检测蛋白质间相互作用的方法。其基本原理是将两个待测蛋白质分别融合到酵母的转录激活因子(如Gal4的DNA结合域和激活域)上,如果这两个蛋白质相互作用,则可以重新组成完整的转录激活因子,启动报告基因的表达。通过检测报告基因的表达水平,就可以判断两个蛋白质是否相互作用。 2. Pull-down实验:这是一种基于亲和纯化的蛋白质相互作用检测方法。首先,将一种蛋白质固定在固相载体上(如琼脂糖珠),然后加入含有待测蛋白质的细胞裂解液。如果待测蛋白质与固定蛋白有相互作用,则会被捕获在固相载体上,经过洗涤后,再通过电泳和 Western blot 等方法检测被捕获的蛋白质,以此来判断两种蛋白质是否有相互作用。 除了以上两种技术,还有其他一些互作蛋白质组学技术,如Co-IP(共同免疫沉淀)、FRET(荧光共振能量转移)、BRET(生物发光共振能量转移)等。每种技术都有其优点和适用范围,根据实际研究需要选择合适的方法是非常重要的。

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