MultiQC是一个用于生物信息学数据质量控制的工具,由Phil Ewels于2016年开发。它的主要功能是将来自多个样本或多个工具的数据结果进行整合和可视化,使得用户可以方便地对整个实验的质量进行评估。
在高通量测序数据分析中,通常需要使用多种工具对原始数据进行质量控制、比对、注释等处理,并生成大量的结果文件。这些文件往往分布在不同的目录下,格式各异,直接查看非常不便。MultiQC可以自动收集这些结果文件,按照样本、工具或参数进行分类和汇总,然后生成一个统一的报告,展示每个步骤的关键指标和图形。
例如,对于RNA-seq数据,MultiQC可以整合FastQC、Trim Galore、STAR、featureCounts等工具的结果,显示每个样本的原始数据质量、接头去除效果、比对率、基因表达量分布等信息。这样,用户无需逐一打开每个结果文件,就可以快速了解整个实验的质量状况。
此外,MultiQC还支持自定义插件,用户可以根据自己的需求添加新的模块,处理特定类型的文件或展示特定的信息。因此,MultiQC不仅是一个质量控制工具,也是一个数据分析和报告生成的平台。