Long-read RNA-seq,即长读长RNA测序技术,是一种用于研究基因表达和转录本结构的高通量测序技术。相比于传统的短读长RNA-seq,long-read RNA-seq具有更高的分辨率,能够检测到更完整的转录本序列。
在long-read RNA-seq中,RNA分子首先被反转录成cDNA,然后通过各种方法(如纳米孔测序或单分子实时测序)进行测序。这些方法可以生成几千到几十万个碱基对的读长,远超过短读长RNA-seq的几百个碱基对。
由于long-read RNA-seq能够捕获更完整的转录本序列,因此它可以更准确地识别剪接变体、可变polyA位点和非编码RNA等复杂转录事件。此外,long-read RNA-seq还可以揭示RNA修饰、RNA-RNA相互作用和RNA结构等信息,为理解基因表达调控机制提供了更全面的视角。
然而,long-read RNA-seq也存在一些挑战,例如测序错误率较高、数据处理和分析复杂等。因此,选择合适的实验设计和数据分析策略对于充分利用long-read RNA-seq的优势至关重要。