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转录组

1 转录组数据介绍 1.1 转录组定义 1.2 RNA测序技术 1.2.1 mRNA-seq 1.2.2 long-read RNA-seq 1.3 转录组数据类型和格式 1.3.1 FASTQ文件 1.3.2 BAM/SAM文件 1.3.3 BED/GTF/GFF文件 2 生物信息学基础 2.1 基因组注释 2.2 生物统计学基础 2.3 R语言编程基础 2.4 Python编程基础 3 转录组数据预处理 3.1 转录组数据质量控制 3.1.1 fastQC 3.1.2 MultiQC 3.2 转录组数据剪接和过滤 3.2.1 Trimmomatic 3.2.2 Cutadapt 3.3 转录组数据比对 3.3.1 HISAT2 3.3.2 STAR 3.3.3 Bowtie2 3.4 比对结果评估 3.4.1 Qualimap 3.4.2 RSeQC 4 转录本组装与定量 4.1 转录本组装 4.1.1 Cufflinks/Cuffmerge/Cuffdiff 4.1.2 StringTie 4.2 转录本定量 4.2.1 HTSeq-count 4.2.2 featureCounts 4.3 差异表达分析 4.3.1 DESeq2 4.3.2 edgeR 4.3.3 limma-voom 5 功能富集分析 5.1 GO富集分析 5.2 KEGG通路富集分析 5.3 Reactome通路富集分析 6 转录组其他高级分析 6.1 转录组之时间序列分析 6.2 转录组之稳健性分析 6.3 转录组之协作网络分析 6.4 转录组之热图、火山图、PCA等可视化工具 7 转录组实例研究 7.1 已发表论文解析 7.2 自己的数据实践操作 8 转录组数据库资源 8.1 SRA 8.2 GEO 8.3 ArrayExpress 8.4 ENSEMBL 8.5 STRING
首页 教程 转录组 STAR
STAR是Situation(情境)、Task(任务)、Action(行动)和Result(结果)的缩写,这是一种用于描述工作经历或解决特定问题的方法。这种方法可以帮助你在面试、求职信或者个人简历中清晰、有条理地展示你的经验和技能。 1. Situation(情境):首先,你需要描述你面临的具体情况或背景。这可能是一个具体的项目、挑战、难题或者是机会。这个部分需要简洁明了,让听者能够快速理解你要讲述的情境。 2. Task(任务):接下来,你需要说明在这个情境下,你的具体任务是什么。这可能是你被分配的任务,也可能是你主动承担的任务。你需要清楚地说明你的目标是什么,以及你打算如何实现这个目标。 3. Action(行动):在这一部分,你需要详细描述你是如何完成这项任务的。你可以列出你采取的具体步骤,也可以描述你的思考过程和决策依据。这部分的重点是你在面对问题时的行动和策略。 4. Result(结果):最后,你需要阐述你的行动带来的结果。这包括你完成任务的情况,你是否达到了预期的目标,以及你的行动对团队、项目或公司产生了什么样的影响。如果可能的话,最好能用数据或事实来支持你的结论。 总的来说,STAR法则是帮助你清晰、有力地表达你的经验、能力和成就的一种有效工具。通过使用STAR法则,你可以更好地展示你的职业素养和个人价值。

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