FASTQ文件是生物信息学中常用的一种文件格式，用于存储高通量测序数据。这种文件格式可以包含每个读取的序列以及对应的质量信息。
FASTQ文件的每一行都有特定的含义。一个完整的FASTQ记录通常由四行组成：
1. 第一行：以'@'字符开始，后面跟着序列的描述信息。这个描述信息可能包括样本名、机器名称、运行号等。
2. 第二行：包含实际的DNA/RNA序列。
3. 第三行：以'+'字符开始，后面可能跟着与第一行相同的描述信息。
4. 第四行：这一行包含了对应于第二行序列的质量信息。质量值通常是ASCII字符，其数值代表了测序错误的可能性。
例如，一个简单的FASTQ记录可能如下所示：
```
@SEQ_ID
GATTTGGGGTTCAAAGCAGTATCGATCAAATAGTAAATCCATTTGTTCAACTCACAGTTT
+
!''*((((***+))%%%++)(%%%%).1***-+*''))**55CCF>>>>>>CCCCCCC65
```
在上述例子中，第一行给出了序列的ID（SEQ_ID）。第二行是DNA序列。第三行以'+'开头，表示接下来的一行是质量信息。第四行是质量信息，每一个字符对应第二行的一个碱基，字符的ASCII值越大，说明该位置测序的质量越高，碱基被正确识别的可能性就越大。
FASTQ文件是生物信息学分析的重要输入数据，通过对其内容的理解和处理，我们可以进行基因组拼接、变异检测、表达定量等多种研究。
