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基因组学

1 基因组学基础 1.1 基因和基因组的概念 1.2 DNA结构和复制 1.3 蛋白质合成 1.4 遗传学基本原理 2 基因组测序技术 2.1 Sanger测序 2.2 下一代测序技术(NGS) 2.2.1 测序原理 2.2.2 主要基因组测序平台介绍 2.2.3 NGS数据分析流程 3 基因组组装 3.1 基因组参考基因组辅助组装 3.2 基因组组装评估与优化 4 基因组注释 4.1 基因预测 4.2 基因功能注释 4.3 非编码RNA识别 5 基因组比较分析 5.1 基因组同源性分析 5.2 基因组多序列比对 5.3 比较基因组学方法 6 表观基因组学 6.1 DNA甲基化 6.2 组蛋白修饰 6.3 非编码RNA的作用 7 基因组测序实验设计与数据分析策略 7.1 基因组测序样品准备与实验设计 7.2 基因组测序的数据质量控制与预处理 7.3 基因组测序的统计学原理与假设检验 7.4 基因组测序的结果解释与报告撰写
首页 教程 基因组学 下一代测序技术(NGS)
下一代测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)是一种高通量的基因测序技术。与传统的Sanger测序方法相比,NGS能够同时对数百万到数十亿个DNA分子进行测序,极大地提高了基因测序的效率和速度。NGS的出现使得大规模基因组研究成为可能,包括全基因组测序、转录组测序、表观基因组学研究等。 NGS的核心原理是通过将DNA分子打断成短片段,然后在这些片段上添加特定的接头序列,再通过PCR扩增形成大量的DNA库。接着,将这些DNA库装载到测序平台上,通过化学反应和光学检测,读取每个DNA分子的碱基序列。最后,通过计算机算法将这些短片段拼接起来,得到完整的基因序列信息。 NGS技术具有许多优点,如速度快、成本低、准确性高等。但是,它也存在一些挑战,如数据处理和解释的复杂性、生物样本质量的影响等。因此,NGS的应用需要结合生物学、计算科学、统计学等多个领域的知识和技术。 NGS技术已经广泛应用于生命科学研究、医学诊断和治疗、农业育种等领域。例如,在癌症研究中,NGS可以帮助识别肿瘤基因突变,为个性化治疗提供依据;在遗传疾病诊断中,NGS可以快速准确地检测出致病基因变异;在农业育种中,NGS可以用于筛选优良品种和研究作物遗传变异。

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