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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 利用PubChem数据进行药物发现和设计
PubChem是一个由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的大型化学物质和生物活性数据集。它包含了超过1亿种化学物质的信息,以及这些物质在各种实验中的生物活性数据。因此,PubChem是药物发现和设计的重要资源。 以下是如何利用PubChem进行药物发现和设计的一些步骤: 1. 数据挖掘:首先,研究人员可以使用PubChem的数据挖掘工具来寻找具有特定生物活性的化合物。例如,他们可以搜索已经显示出对抗某种疾病的活性的化合物。 2. 药物设计:一旦找到了有希望的化合物,研究人员就可以开始设计新的药物。这可能涉及到修改化合物的结构,以提高其效力或降低其副作用。 3. 生物活性测试:新设计的药物需要经过一系列的生物活性测试,以确定它们是否真的有效。这些测试的结果可以反馈到PubChem中,以便其他研究人员可以使用。 4. 合成和优化:如果新的药物设计被证明是有效的,那么就需要合成这种药物,并进行进一步的优化。这个过程可能需要反复进行,直到找到最有效的药物版本。 5. 临床试验:最后,新药物需要通过临床试验,以证明它是安全和有效的。如果一切顺利,那么这种新药就可以获得批准,并用于治疗疾病。 总的来说,PubChem提供了一个宝贵的平台,使研究人员能够更有效地进行药物发现和设计。

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