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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 PubChem数据的来源和质量控制
PubChem是一个由美国国家医学图书馆(NLM)维护的大型化学数据库,它包含了大量的小分子和生物活性数据。这些数据主要来自以下三个来源: 1. Substance Contributors:这些是向PubChem提交物质样本的组织和个人。他们包括制药公司、研究机构、政府实验室和大学等。 2. Depositors to PubChem BioAssay:这些是提交生物活性数据的组织和个人。他们包括药物筛选中心、学术研究团队和政府资助的研究项目。 3. Data Exchange Partners:这些是与PubChem进行数据交换的其他数据库和服务,如ChEMBL、ZINC和SureChEMBL等。 为了确保数据的质量和准确性,PubChem采取了一系列的质量控制措施: 1. 数据验证:所有提交到PubChem的数据都会经过严格的验证过程,以确保它们符合特定的标准和格式。 2. 数据审查:PubChem有一个专业的数据审查团队,他们会定期检查和审核所有的数据,以确保其质量和准确性。 3. 用户反馈:PubChem鼓励用户报告任何可能存在的数据问题,这些反馈会被用来改进数据库的质量。 4. 数据源评估:PubChem会对所有的数据源进行评估,以确定他们的数据质量是否满足要求。 5. 数据清理:PubChem会定期进行数据清理活动,以删除重复的、错误的或过时的数据。 总的来说,通过这些严格的质量控制措施,PubChem能够提供高质量、准确和最新的化学和生物活性数据,为科研工作者提供了重要的资源。

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