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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 PubChem概述
PubChem是美国国家医学图书馆(NLM)的一个开放的化学信息数据库,它包含了关于小分子和生物活性数据的信息。这个数据库是由美国国立卫生研究院(NIH)下属的NCBI(National Center for Biotechnology Information)开发和维护的。 PubChem包含三个主要的数据仓库:PubChem Substance,PubChem Compound和PubChem BioAssay。PubChem Substance是一个原始的、未经处理的提交者提供的化学数据存储库;PubChem Compound是对Substance进行标准化和清理后得到的具有唯一标识符CID(Compound Identifier)的化合物存储库;PubChem BioAssay则包含了来自多个来源的生物活性数据。 PubChem的目标是为科学家、研究人员、教育工作者和公众提供一个免费、易于访问的化学信息资源。用户可以通过关键词搜索、结构搜索或者直接输入化合物的名称或CAS号来查找所需的信息。此外,PubChem还提供了API(应用程序接口),使得开发者可以将PubChem的数据集成到自己的应用中。 总的来说,PubChem是一个非常重要的化学信息资源,对于药物发现、化学研究、教育等多个领域都有着重要的作用。

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