创作中心
反馈咨询
欢迎添加微信!
微信号:z_gqing
微信二维码:

NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 dbSNP数据的提交和验证流程
dbSNP是一个由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的数据库,它收集和提供单核苷酸多态性(SNP)的信息。SNP是基因组中单个核苷酸的位置变异,它们在个体间广泛存在,并且可能与疾病易感性和药物反应性有关。 以下是dbSNP数据的提交和验证流程: 1. 数据准备:首先,研究人员需要对他们的实验数据进行分析,确定哪些位点可能是SNP。这些数据通常来自于全基因组测序、靶向基因测序或基因芯片等实验。 2. 数据提交:然后,研究人员可以通过dbSNP的在线提交工具将这些数据提交到数据库中。提交的数据包括SNP的位置信息、变异类型、样本来源等信息。 3. 初始验证:dbSNP会对提交的数据进行初步的格式和内容检查,以确保数据的质量。如果数据存在问题,dbSNP会返回错误信息,要求研究人员修改并重新提交。 4. 实验验证:对于某些重要的SNP,dbSNP可能会要求研究人员提供实验验证数据。这通常涉及到对SNP位点进行PCR扩增和测序,以确认SNP的存在。 5. 数据发布:一旦数据通过了所有验证,dbSNP就会将其添加到数据库中,并公开发布。这些数据可供其他研究人员使用,帮助他们了解SNP的分布和功能。 6. 数据更新:随着时间的推移,研究人员可能会发现新的SNP或修正已知SNP的信息。他们可以随时向dbSNP提交这些更新,dbSNP会定期发布新的数据版本。 总的来说,dbSNP的数据提交和验证流程是一个严谨的过程,旨在确保数据库中的数据准确可靠。

官方微信
点击收藏 编辑日记
木牛零码 Newmer生信 公司产品 意见反馈 联系我们 关于我们 招合伙-招聘-兼职
Copyright © 2021-2024 上海牛马人生物科技有限公司 沪ICP备 2022007390号-2