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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 GenBank数据提交流程
GenBank是一个由美国国家生物技术信息中心(NCBI)维护的开放获取分子序列数据库。它包含了所有公开可用的DNA和蛋白质序列数据。如果你有新的基因或蛋白质序列需要提交到GenBank,可以按照以下步骤进行: 1. 收集和整理你的数据:首先,你需要收集你的实验数据,并将其整理成符合GenBank格式的文件。这通常包括序列信息、功能注释、参考文献等。 2. 使用SeqBuilder或类似软件创建GenBank格式文件:有许多软件可以帮助你将数据转换为GenBank格式,如SeqBuilder、Geneious等。这些软件通常都有用户友好的界面,你可以很容易地输入你的数据并生成GenBank文件。 3. 提交GenBank文件:一旦你有了GenBank文件,就可以通过NCBI的WebIn工具提交了。首先,你需要在NCBI上创建一个账户。然后,登录WebIn,选择“Submit Data”选项,再选择“Direct Submission”,最后上传你的GenBank文件。 4. 审核和发布:NCBI的工作人员会对你的提交进行审核,以确保其质量和准确性。如果一切顺利,你的数据将在几天内被添加到GenBank中,并对全世界的研究人员开放。 5. 更新和修改:如果你的数据有任何更新或修正,可以通过WebIn工具重新提交。这样,你的数据就会被更新,以反映最新的研究成果。 需要注意的是,提交GenBank数据的过程可能需要一些专业知识和技能。如果你对此感到困难,可以寻求专业的生物信息学服务帮助。

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