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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 ClinVar和dbGaP
ClinVar和dbGaP是两个重要的生物医学数据库,它们在基因组学、遗传学和临床医学领域发挥着重要作用。 1. ClinVar:ClinVar是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家人类基因组研究所(NHGRI)和国家生物技术信息中心(NCBI)共同维护的一个公开数据库。这个数据库收集并整合了来自全球各地的研究机构和实验室关于人类基因变异与疾病关联性的数据。ClinVar的目标是提供一个共享平台,使得科研人员、临床医生和公众可以获取到最新的基因变异与疾病的关联性信息。这些信息对于理解疾病的遗传基础、制定个性化的治疗方案以及进行遗传咨询等都具有重要的价值。 2. dbGaP:dbGaP是NCBI维护的另一个公开数据库,全称为Database of Genotypes and Phenotypes。这个数据库主要存储和分享人类遗传变异和表型数据,这些数据来自于各种遗传学和流行病学研究。dbGaP中的数据包括基因型数据(如SNP、CNV等)、表型数据(如疾病状态、生理指标等)以及环境暴露数据等。通过dbGaP,研究人员可以获取到大量的遗传学和表型数据,这对于研究基因与疾病之间的关系、探索疾病的遗传机制以及开发新的诊断和治疗方法都具有重要的意义。 总的来说,ClinVar和dbGaP都是重要的生物医学数据库,它们为科研人员、临床医生和公众提供了丰富的基因变异和表型数据,对于推动基因组学、遗传学和临床医学的发展都起到了积极的作用。

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