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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程
NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国家生物技术信息中心,为科研人员提供了一个全面的生物信息资源库。其中包括了BioProject、BioSample和BioSystems等数据库。 1. BioProject提交和管理流程: - 创建BioProject:首先,你需要在NCBI的网页上创建一个新的BioProject。这需要填写一些基本信息,如项目的名称、描述、联系人等。 - 提交数据:创建完BioProject后,你可以开始提交你的数据。这包括基因组序列、蛋白质序列、表达谱数据等。 - 数据审核:NCBI会对你的数据进行审核,以确保其质量和准确性。 - 数据发布:审核通过后,你的数据就会被发布到NCBI的数据库中,供全球的科研人员使用。 2. BioSample提交和管理流程: - 创建BioSample:在NCBI的网页上创建一个新的BioSample。这需要填写一些基本信息,如样本的来源、处理方法、测序平台等。 - 提交数据:创建完BioSample后,你可以开始提交你的数据。这包括样本的基因组序列、蛋白质序列、表观遗传学数据等。 - 数据审核:NCBI会对你的数据进行审核,以确保其质量和准确性。 - 数据发布:审核通过后,你的数据就会被发布到NCBI的数据库中,供全球的科研人员使用。 3. BioSystems提交和管理流程: - 创建BioSystem:在NCBI的网页上创建一个新的BioSystem。这需要填写一些基本信息,如系统的名称、描述、组成部分等。 - 提交数据:创建完BioSystem后,你可以开始提交你的数据。这包括系统的基因组序列、蛋白质序列、代谢途径等。 - 数据审核:NCBI会对你的数据进行审核,以确保其质量和准确性。 - 数据发布:审核通过后,你的数据就会被发布到NCBI的数据库中,供全球的科研人员使用。 总的来说,NCBI的这三个数据库提供了从项目级别到样本级别再到系统级别的全方位的数据提交和管理服务,为全球的科研人员提供了极大的便利。

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