创作中心
反馈咨询
欢迎添加微信!
微信号:z_gqing
微信二维码:

NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述
NCBI (National Center for Biotechnology Information) 是美国国立卫生研究院(NIH)的一个部门,是全球最大的生物医学信息中心之一。其主要任务是收集、组织和提供生物学和医学研究的数据资源。NCBI提供了多种数据库,包括GenBank(基因序列数据库),PubMed(医学文献数据库)等。本文将重点介绍BioProject, BioSample和BioSystems这三个数据库。 1. NCBI BioProject: BioProject是一个存储大量生物学项目的数据库,这些项目可以是一个实验、一个研究或者一系列相关的工作。每个项目都有一个唯一的标识符(Project ID),并包含关于该项目的详细描述,例如项目的目标、方法、结果和结论。此外,BioProject还链接到其他相关的NCBI数据库,如Gene, PubMed等,以便研究人员能够轻松地找到与项目相关的所有数据和信息。 2. NCBI BioSample: BioSample数据库存储了各种生物样本的信息,包括样品的来源、处理方式、测序方法等。每个样本都有一个唯一的标识符(BioSample ID),并且可以关联到多个BioProject。这样,研究人员就可以追踪一个样本在不同项目中的使用情况,从而更好地理解和利用这些数据。 3. NCBI BioSystems: BioSystems数据库收集了一系列生物系统的相关信息,包括细胞通路、代谢途径、信号转导网络等。每个系统都由一组相关的基因或蛋白质组成,并且有一个唯一的标识符(BioSystem ID)。BioSystems数据库为研究人员提供了一个全面的视角来理解复杂的生物过程和疾病机制。 总的来说,NCBI的这三个数据库构成了一个完整的生物信息学生态系统,从项目的规划和实施,到样本的采集和处理,再到系统的分析和解释,为生物医学研究提供了强大的支持。

官方微信
点击收藏 编辑日记
木牛零码 Newmer生信 公司产品 意见反馈 联系我们 关于我们 招合伙-招聘-兼职
Copyright © 2021-2024 上海牛马人生物科技有限公司 沪ICP备 2022007390号-2