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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 BioProject, BioSample和BioSystems
BioProject、BioSample和BioSystems是三个与生物信息学相关的概念,它们都是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)开发和维护的数据库。 1. BioProject:BioProject是一个收集和组织生物学研究项目的数据库。它包含了各种类型的项目,包括基因组测序、转录组分析、蛋白质结构预测等。每个项目都有一个唯一的ID号,并且可以链接到其他NCBI数据库中的相关数据,例如GenBank、PubMed等。BioProject可以帮助研究人员找到他们感兴趣的项目,并了解这些项目的目标、方法和结果。 2. BioSample:BioSample是一个收集和描述生物学样本的数据库。它包含了各种类型的样本,包括细胞、组织、微生物等。每个样本都有一个唯一的ID号,并且可以链接到其他NCBI数据库中的相关数据,例如GenBank、SRA等。BioSample可以帮助研究人员找到他们感兴趣的样本,并了解这些样本的来源、处理方法和实验设计。 3. BioSystems:BioSystems是一个收集和组织生物学系统的数据库。它包含了各种类型的系统,包括代谢途径、信号传导通路、基因调控网络等。每个系统都有一个唯一的ID号,并且可以链接到其他NCBI数据库中的相关数据,例如Gene、Protein等。BioSystems可以帮助研究人员了解生物学过程的复杂性和相互作用,并发现新的生物学知识和应用价值。

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