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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 NCBI提供的服务和资源
NCBI (National Center for Biotechnology Information) 是美国国家生物技术信息中心,隶属于美国国立卫生研究院(NIH),是全球最大的生物医学文献数据库和序列数据库之一。以下是NCBI提供的主要服务和资源: 1. PubMed: 这是一个免费的搜索引擎,用于检索Medline、OldMedline、PubMed Not-MEDLINE以及出版商直接提交给NCBI的生物医学文献。 2. GenBank: 这是NCBI维护的DNA序列数据库,包含所有公开可用的DNA序列数据。 3. Protein Database (Protein): 这个数据库包含了由GenBank、EMBL-Bank和DDBJ数据库中的核酸序列翻译而来的蛋白质序列,以及其他来源的蛋白质序列。 4. Gene: 这是一个收集了关于已知基因的综合信息的数据库,包括其功能、位置、相关疾病等。 5. PubMed Central (PMC): 这是一个全文本的期刊文章档案库,提供免费的全文下载。 6. BLAST: 这是一个在线工具,可以用来比较用户提供的序列与GenBank中的序列。 7. OMIM: Online Mendelian Inheritance in Man,一个收集人类遗传病信息的数据库。 8. dbSNP: 单核苷酸多态性数据库,收集了所有已知的人类和其他物种的单核苷酸变异信息。 9. Taxonomy: 这是一个分类学数据库,提供了生物分类系统的详细信息。 10. SRA: Sequence Read Archive,这是一个存储高通量测序原始数据的档案库。 以上就是NCBI提供的主要服务和资源,这些资源对于生物医学研究者来说是非常宝贵的工具。

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