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NCBI数据库

1 NCBI简介 1.1 NCBI的历史和发展 1.2 NCBI的组织结构和功能 1.3 NCBI提供的服务和资源 2 PubMed 2.1 PubMed概述 2.2 如何在PubMed中进行文献检索 2.3 PubMed高级搜索技巧 2.4 如何获取PubMed中的全文文献 2.5 PubMed与MyNCBI的使用 3 GenBank 3.1 GenBank概述 3.2 如何在GenBank中查询基因和序列信息 3.3 GenBank数据提交流程 3.4 使用GenBank数据进行分子生物学研究 4 BLAST 4.1 BLAST概述 4.2 BLAST的基本原理和算法 4.3 如何使用BLAST进行序列比对 4.4 BLAST高级选项和参数设置 4.5 利用BLAST结果进行数据分析 5 OMIM 5.1 OMIM概述 5.2 如何在OMIM中查询遗传疾病信息 5.3 OMIM数据的更新和维护 5.4 利用OMIM数据进行遗传学研究 6 dbSNP 6.1 dbSNP概述 6.2 如何在dbSNP中查询单核苷酸多态性(SNP)信息 6.3 dbSNP数据的提交和验证流程 6.4 利用dbSNP数据进行群体遗传学研究 7 PubChem 7.1 PubChem概述 7.2 如何在PubChem中查询化学物质信息 7.3 PubChem数据的来源和质量控制 7.4 利用PubChem数据进行药物发现和设计 8 SRA 8.1 SRA概述 8.2 如何在SRA中查询测序数据信息 8.3 SRA数据的提交和管理流程 8.4 利用SRA数据进行生物信息学分析 9 Taxonomy 9.1 NCBI Taxonomy概述 9.2 如何在NCBI Taxonomy中查询物种分类信息 9.3 NCBI Taxonomy的数据更新和维护 9.4 利用NCBI Taxonomy数据进行系统发育学研究 10 BioProject, BioSample和BioSystems 10.1 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems概述 10.2 如何在NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库中查询相关项目、样本和系统信息 10.3 NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据提交和管理流程 10.4 利用NCBI BioProject, BioSample和BioSystems数据库进行整合生物学研究 11 其他NCBI资源 11.1 ClinVar和dbGaP 11.2 Conserved Domain Database (CDD) 11.3 Epigenomics 11.4 Gene Expression Omnibus (GEO) 11.5 PopSet 11.6 Protein Clusters 11.7 PubMed Health 11.8 PubMed Central (PMC)
首页 教程 NCBI数据库 NCBI的组织结构和功能
NCBI(National Center for Biotechnology Information)是美国国立卫生研究院(NIH)的一个下属机构,主要负责提供生物信息学服务和资源。它的组织结构主要包括以下几个部门: 1. 核酸序列部:负责管理和维护GenBank,这是一个全球最大的公开可用的核酸序列数据库。 2. 蛋白质序列部:负责管理和维护Protein Database (PDB),这是一个存储蛋白质三维结构信息的数据库。 3. 生物技术信息中心:负责提供各种生物信息学工具和服务,包括BLAST、Entrez等。 4. 生物医学文献信息系统:负责管理和维护PubMed,这是一个免费的全文医学文献搜索引擎。 5. 分子生物学计算实验室:负责进行分子生物学的计算研究,并开发新的算法和工具。 NCBI的主要功能包括: 1. 提供生物信息学数据和资源:如GenBank、PDB、PubMed等。 2. 开发和维护生物信息学工具:如BLAST、Entrez等。 3. 进行分子生物学的计算研究:包括基因组学、蛋白质组学、系统生物学等领域。 4. 提供教育和培训:包括在线教程、研讨会、工作坊等。 5. 与其他机构合作:NCBI与世界各地的研究机构和科学家合作,共同推动生物信息学的发展。

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