MLST(Multi-Locus Sequence Typing)是一种基于多位点序列分型的细菌分类和鉴定方法。它通过比较多个管家基因座的序列差异来区分不同的菌株,具有高度的分辨率和可比性。
MLST结果解读:
1. ST(Sequence Type):每个菌株都会被赋予一个唯一的ST编号,这个编号是基于其7个管家基因座的等位基因组合。如果两个菌株在所有7个基因座上的等位基因都相同,那么它们就被认为是同一ST。
2. CC(Clonal Complex):CC是一组相关的ST,它们在至少6个管家基因座上具有相同的等位基因。CC可以帮助我们理解菌株之间的进化关系。
3. eBURST:eBURST是一种分析ST之间关系的工具,它可以将相似的ST聚类到一起,形成一种“谱系”。
MLST的应用:
1. 疾病暴发调查:通过对疾病暴发中的菌株进行MLST,可以确定菌株的来源和传播途径。
2. 菌株分型:MLST可以提供高分辨率的菌株分型,有助于疾病的诊断和治疗。
3. 微生物进化研究:通过比较不同菌株的MLST结果,可以揭示微生物的进化历程。
4. 抗生素耐药性研究:MLST可以与抗生素耐药性数据相结合,研究耐药性的分布和传播。
5. 预防和控制感染:了解菌株的遗传背景和传播模式,可以帮助制定有效的预防和控制策略。