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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG与其他数据库的交互
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是一个综合性的生物信息学数据库,提供了从基因组到分子功能、细胞过程和生物系统的多层次信息。KEGG与其他数据库的交互主要包括以下几个方面: 1. 数据交换:KEGG通过与其他数据库的数据交换,以获得更全面、准确的信息。例如,KEGG与GenBank、RefSeq等核酸序列数据库进行数据交换,获取基因和蛋白质序列信息。 2. 数据映射:KEGG将其他数据库中的数据映射到自己的数据库中,以便用户可以更容易地找到相关信息。例如,KEGG将UniProt中的蛋白质数据映射到KEGG PATHWAY中,使用户能够查看蛋白质在代谢通路中的作用。 3. 数据整合:KEGG将来自不同数据库的数据进行整合,提供了一种统一的视角来看待生物学问题。例如,KEGG将基因表达数据、蛋白质相互作用数据和代谢通路数据整合在一起,为研究者提供了深入理解生物学系统的机会。 4. 跨库查询:KEGG支持跨库查询,使得用户可以在一个数据库中查找另一个数据库中的信息。例如,用户可以通过KEGG搜索PubChem中的化学物质信息。 这些交互使得KEGG成为了一个强大的工具,可以帮助研究者更好地理解和探索生物学系统。

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