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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 如何理解KEGG ENVIRON图
KEGG ENVIRON图是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中的一部分,主要描述了各种环境中的生物化学反应网络。这些环境包括但不限于大气、水体、土壤等。 在KEGG ENVIRON图中,每个节点代表一个化合物,每条边代表一种生物化学反应。这些反应可能是由特定的酶催化的,也可能是自发发生的。节点的颜色和形状可以表示化合物的性质,如有机物、无机物、气体等。 通过分析KEGG ENVIRON图,我们可以了解在特定环境中哪些化合物是重要的,哪些生物化学反应是关键的。这对于环境科学、生态学、微生物学等领域都具有重要的意义。例如,我们可以利用这些信息来研究污染物的降解途径,或者预测气候变化对生态系统的影响。 总的来说,KEGG ENVIRON图提供了一种可视化的方法,帮助我们理解复杂的环境生物化学过程。

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