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KEGG数据库

1 KEGG介绍 1.1 KEGG的历史和背景 1.2 KEGG的主要功能和应用领域 2 KEGG数据库概述 2.1 KEGG PATHWAY 2.2 KEGG BRITE 2.3 KEGG MODULE 2.4 KEGG DISEASE 2.5 KEGG DRUG 2.6 KEGG ENVIRON 3 KEGG PATHWAY分析 3.1 如何查询KEGG PATHWAY 3.2 如何理解KEGG PATHWAY图 3.3 如何进行KEGG PATHWAY富集分析 4 KEGG BRITE分析 4.1 如何查询KEGG BRITE 4.2 如何理解KEGG BRITE图 4.3 如何进行KEGG BRITE富集分析 5 KEGG MODULE分析 5.1 如何查询KEGG MODULE 5.2 如何理解KEGG MODULE图 5.3 如何进行KEGG MODULE富集分析 6 KEGG DISEASE分析 6.1 如何查询KEGG DISEASE 6.2 如何理解KEGG DISEASE图 6.3 如何进行KEGG DISEASE富集分析 7 KEGG DRUG分析 7.1 如何查询KEGG DRUG 7.2 如何理解KEGG DRUG图 7.3 如何进行KEGG DRUG富集分析 8 KEGG ENVIRON分析 8.1 如何查询KEGG ENVIRON 8.2 如何理解KEGG ENVIRON图 8.3 如何进行KEGG ENVIRON富集分析 9 KEGG与其他数据库的交互 9.1 如何将基因ID转换为KEGG ID 9.2 如何将KEGG ID转换为基因ID 9.3 如何将KEGG ID转换为Uniprot ID 9.4 如何将Uniprot ID转换为KEGG ID 10 KEGG在生物信息学中的应用 10.1 KEGG在基因组学中的应用 10.2 KEGG在转录组学中的应用 10.3 KEGG在蛋白质组学中的应用 10.4 KEGG在代谢组学中的应用
首页 教程 KEGG数据库 KEGG ENVIRON分析
KEGG ENVIRON是KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库的一部分,主要用于研究环境微生物的基因组和代谢途径。这个数据库包含了大量的环境样品数据,包括土壤、水、空气等,以及这些环境中存在的微生物的基因组信息。 在KEGG ENVIRON中,可以进行以下几种分析: 1. 环境样品比较:通过比较不同环境样品中的微生物群落结构,可以了解各种环境条件下微生物的分布情况。 2. 微生物功能分析:通过分析微生物的基因组信息,可以了解它们具有的代谢功能,从而推断其在环境中的作用。 3. 代谢途径分析:通过分析微生物的代谢途径,可以了解它们如何利用环境中的物质进行生长和繁殖。 4. 环境因素影响分析:通过比较不同环境因素下的微生物群落结构和功能,可以了解环境因素对微生物的影响。 总的来说,KEGG ENVIRON是一个强大的工具,可以帮助研究人员深入了解环境微生物的生物学特性,以及它们在各种环境条件下的生存策略。

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